各類果樹作物如蘋果、葡萄、桃、梨、獼猴桃、櫻桃、香蕉、柑橘、杏、李、荔枝、龍眼等，各類經濟作物如棉花、大豆、馬鈴薯、紅薯、油菜、花生、茶葉、煙草、中藥等，各類蔬菜作物如西紅柿、黃瓜、辣椒、茄子、白菜、缸豆、冬瓜、苦瓜、苦瓜、芹菜、甘藍等，各類水果作物如甜瓜、西瓜、草莓等各類糧食作物如小麥、玉米、水稻、高粱等，都可以使用殼寡糖。

       殼寡糖可以用來防治很多種的真菌、細菌、病毒病等病害，同時對抑制和防治作物上的根結線蟲也有非常突出的效果。比如說，殼寡糖可以用來防治病毒病、花葉病、小葉病、白粉病、黑霉病、霜霉病、斑點病、立枯病、猝倒病、根腐病、軟腐病、青枯病、枯萎病、黑斑病、疫病、炭疽病、稻瘟病等數由真菌、細菌、病毒所誘發的數十種病害，如果用藥時配合其他殺菌藥物一起使用，病害防治效果會更加顯著。

      殼寡糖可以用來拌種、浸種、包衣，也可以用來噴霧、灌根、淋根、沖施、滴灌等。

       殼寡糖可以與非堿性的葉面肥、殺菌劑、殺蟲劑一起使用，但不可與堿性的肥藥等物質一起使用。